Исследовательская группа обнаружила девять новых видов коронавируса

Бывший научный сотрудник UBC возглавил международную исследовательскую группу по повторному анализу всех общедоступных данных секвенирования РНК, что позволило обнаружить почти в десять раз больше РНК-вирусов, чем было известно ранее, включая несколько новых видов коронавирусов в некоторых неожиданных местах. О новой сенсации сообщает портал Phys.org.

Эта планетарная база данных РНК-вирусов может помочь быстро идентифицировать распространение вируса на людей, а также те патогены, которые поражают домашний скот, сельскохозяйственные культуры и исчезающие виды.

Доктор Артем Бабаян возглавил исследование. Ошеломляющие результаты работы были опубликованы в журнале Nature на этой неделе. По словам Бабаяна, работая с Центром облачных инноваций, государственным и частным сотрудничеством между UBC и Amazon Web Services, ученые создали суперкомпьютер на AWS, эквивалентный по мощности 22 500 процессорам.

Суперкомпьютер прочитал 20 миллионов гигабайт общедоступных данных о последовательности генов из 5,7 миллиона биологических образцов по всему миру в поисках определенного гена, указывающего на присутствие РНК-вируса. Образцы собирались и свободно распространялись в мировом исследовательском сообществе в течение 13 лет и включали в себя все, от образцов ледяных кернов до навоза животных.

Исследователи из проекта Serratus обнаружили 132 000 РНК-вирусов (ранее было известно всего 15 000) и девять новых видов коронавирусов. По оценкам Бабаяна, без CIC и облака AWS традиционному суперкомпьютеру потребовалось бы более года и сотни тысяч долларов, чтобы выполнить анализ.

«Мы вступаем в новую эру понимания генетического и пространственного разнообразия вирусов в природе и того, как самые разные животные взаимодействуют с этими вирусами. Надеемся, что нас не застанет врасплох, если что-то вроде SARS-CoV-2 — новый коронавирус, вызывающий COVID-19, — появится снова», — заявил главный автор исследования.